针对您提出的问题，如果工厂确实没有活干，员工拒绝补工时，工厂单方面扣除员工工资可能涉及违法。根据《劳动法》的相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。在【解答内容】中也提到了，员工被找借口拖欠工资时，可以寻求法律途径解决。因此，如果工厂无合理理由扣除员工工资，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
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若员工与工厂签订了合同但未明确工时不足的处理方式，员工拒绝补工时，处理方案如下：首先，双方应依据合同条款及《合同法》精神进行协商；协商不成，员工可向劳动监察部门投诉，要求工厂合理解释并支付应得工资；或者，员工也可选择申请劳动仲裁，由仲裁机构进行裁决。
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从法律角度看，员工应首先与工厂协商，明确工时及工资支付问题。协商无果时，可收集工作记录、工时证明等证据，向单位所在地的劳动监察大队投诉。同时，考虑申请劳动仲裁，确保自己的工资权益不受侵害。必要时，还可向法院提起诉讼，维护自身合法权益。