合作医疗费用能否退回需看具体情况，若符合退费条件则可退。依据《关于新型农村合作医疗的管理办法》，重复缴纳或符合特定减免条件的，可申请退费。如不属于减免人员且未享受医疗待遇，可尝试申请。不及时处理可能导致资金浪费，无法享受应有的医疗保障。
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合作医疗退费处理分两步。首先，确认自己是否符合退费条件，如重复缴纳或属于减免人员等；其次，根据具体情况选择退费方式，线上申请需准备好相关电子材料，线下则需携带身份证、缴费证明等材料前往办理。不同情况所需材料可能不同，需提前咨询清楚。
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合作医疗退费常见方式有线上申请与线下办理两种。线上可通过当地合作医疗官方平台或APP申请；线下则需前往合作医疗管理部门办理。选择时需考虑便捷性与个人实际情况，线上方便但可能需提交电子材料，线下更直接但需时间成本。