用工单位可以存档外包人员的劳动合同。依据《劳动合同法》，用人单位需保存已解除或终止的劳动合同文本至少二年。若不及时处理，可能导致劳动纠纷时无法提供关键证据，影响企业权益。
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外包人员劳动合同存档的常见处理方式有：一是由签订劳动合同的企业人力资源部存档；二是在企业所在地人力资源与社会保障局备案并存档。选择哪种方式，应基于合同管理的便捷性、安全性及法规遵从性综合考虑。
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可以。具体操作：1.企业人力资源部应设立专门档案，妥善保存劳动合同；2.定期检查和更新存档情况，确保合同完整无损；3.若选择在人社局备案，需按规定流程提交材料并申请存档；4.遵守相关法规，保护劳动者隐私。