拥有两个档案办理退休，需先核实档案真实性并合并或选择主要档案。

分析说明：在办理退休时，如遇到两份档案的情况，首先要做的是核实两份档案的真实性和完整性，确保没有伪造或篡改的情况。若两份档案内容存在差异或冲突，需进一步调查核实。若两份档案均真实有效，可考虑合并成一个更完整的个人档案，或选择一个更能反映个人职业生涯的主要档案进行退休办理。

提醒：若两份档案存在严重冲突，且无法核实其真实性，这可能表明问题比较严重，应及时寻求专业律师或相关机构的帮助。
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处理方式：

从法律角度讲，处理两份档案的方式主要包括核实档案真实性、合并档案或选择主要档案。

选择建议：若两份档案内容相似且没有冲突，合并档案是一个较好的选择；若两份档案内容差异较大，或有冲突之处，需先核实其真实性，再根据实际情况选择一份主要档案进行退休办理。